Analyses en spectrométrie de masse et séquençage
GENEPEP vous propose des services de haute qualité à des prix attractifs dans les domaines de la Caractérisation Structurale de Peptides et de Protéines ainsi qu’un service d’Analyse-Contrôle Qualité (pureté, intégrité, masse moléculaire, etc).
Nous proposons pour la caractérisation structurale de peptides et de protéines des services qui s’articulent autour du séquençage par dégradation d’Edman et des techniques les plus récentes par spectrométrie de masse (par électronébulisation et / ou désorption laser assistée par matrice) en tandem.
Nos analyses sont réalisées par des experts dans le domaine de la chimie-biochimie des peptides et protéines (synthèse, purification, caractérisation structurale), et de la spectrométrie de masse.
Nos services sont adaptés à vos objectifs et exigences en termes de sensibilité, résolution et fiabilité.
Caractérisation Structurale de Peptides et Protéines (CSPP)
Nous analysons des peptides / protéines naturels, synthétiques ou recombinants exprimés dans des systèmes hétérologues ou homologues.
- Analyse de protéines en solution ou sur différents supports solides (gel d’acrylamide, membrane de transfert, etc) ;
- Traitement de l’échantillon, analyses des informations et remise des données ;
- Analyses ponctuelles ou contrats annuels ;
- Pas de limite minimale dans le nombre d’échantillons à analyser ;
- Confidentialité et éthique sont nos priorités ;
- Acquisition et traitement des données par des experts en peptidomique et protéomique afin de vous assurer les meilleurs résultats ;
- Nous fournissons un rapport électronique (pdf) détaillé sur les résultats obtenus. Les résultats sont également disponibles par fax et / ou lettre sur requête spécifique.
Les services proposés :
- Mesure de la masse moléculaire (monoisotopique, moyenne) par spectrométrie de masse par désorption assistée par matrice (MALDI-MS) ou par électronébulisation (ESI-MS) ;
- Séquençage par la chimie d’Edman ou par spectrométrie de masse en tandem (MS / MS) ;
- Caractérisation de protéines par une combinaison de traitements chimiques et / ou enzymatiques (trypsinolyse, etc), cartographie massique et séquençage ;
- Séquençage de novo par spectrométrie de masse en tandem pour l’identification de séquences partielles (tags) pour la réalisation de sondes oligonucléotidiques ;
- Digestions enzymatiques, purification des produits de la digestion par HPLC, analytique ou avec un nano-débit, couplée ESI-MS / MS (nano-LC-ESI-MS / MS). Le séquençage peut être réalisé soit par la chimie d’Edman, MALDI-MS / MS ou par ESI-MS / MS ;
- Réduction / alkylation de cystéines par différents traitements chimiques (iodoacétamide, vinyl-pyridine, etc) ;
- Détermination de modifications post-traductionnelles : cyclisation N-terminale, présence de résidus cystéines, etc ;
- Définition de ponts disulfures (nombre, arrangement) par réduction / alkylation ménagée, digestion enzymatique, empreinte massique et séquençage ;
- Rapport électronique (pdf) détaillé comprenant : (i) une référence de produit, (ii) un bref descriptif expérimental, (iii) une analyse complète des résultats obtenus, (iv) les profils HPLC et les spectres de masse, (v) les séquences obtenues, (vi) la couverture de la séquence, (vii) l’identification de la protéine, et (viii) les recherches dans les banques de données sur requête spécifique. Des données complémentaires peuvent êtres fournies sur votre requête : présence de modifications post-traductionnelles, identification de contaminants, suggestions expérimentales, etc.
Services d’Analyse - Contrôle Qualité (ACQ)
Grâce à son service ACQ, GENEPEP peut rapidement fournir une information sur la pureté et l’identité de votre peptide / protéine d’origine naturelle produits par une approche de synthèse chimique ou par une procédure d’expression dans des systèmes hétérologues ou homologues. Ce type de service concerne également des peptides et protéines avec des acides aminés non-naturels, ou qui portent des modifications chimiques. Les procédures standards suivantes sont utilisées :
- Mesure de la masse moléculaire monoisotopique ou moyenne. Cette mesure est réalisée par MALDI-MS, ESI-MS et ou par nanoLC-ESI-MS / MS ;
- Détermination de la pureté par MALDI-MS, ESI-MS et / ou par nanoLC-ESI-MS ;
- Vérification d’une pureté par HPLC sur colonne (analytique, nano) de phase inverse (C8, C18) ;
- Rapport détaillé validé par des experts en chromatographie et spectrométrie de masse.
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